Pfam

Pfam es una base de datos de familias de proteínas que incluye sus anotaciones y múltiples alineaciones de secuencias generadas utilizando modelos ocultos de Markov.

Para cada familia de proteínas presentes en Pfam se puede obtener: aproximadamente el 74% de las secuencias de proteínas tienen al menos un vínculo con Pfam. Este número se denomina cobertura de secuencia. El Pfam - una base de datos contiene información sobre dominios de proteínas y familias de proteínas Pfam - A es una base de datos separada curada por operadores humanos que contiene más de 10. 000 voces. En cada artículo se almacena una alineación de secuencia de aminoácidos y el modelo correspondiente de Hidden Markov. Estas plantillas ocultas de Markov se pueden utilizar para buscar datos de secuencia gracias al paquete del programa HMMER escrito por Sean Eddy. Dado que Pfam - una entradas no cubren actualmente todas las proteínas conocidas, se generó automáticamente un suplemento llamado Pfam - B. La sección Pfam-B contiene un gran número de pequeñas familias de proteínas derivadas de grupos producidos por un algoritmo llamado ADDA. Aunque de menor calidad, la sección de familias contenida en Pfam-B puede ser útil cuando no se encuentra una familia de proteínas en Pfam-A. la base de datos iPfam se basa en la descripción del dominio Pfam. Esta base de datos investiga si las diferentes proteínas descritas juntas (basadas en la estructura proteica derivada de la base de datos de The Protein Data Bank) son lo suficientemente cercanas como para interactuar potencialmente. En octubre de 2009, el lanzamiento "Pfam 24. 0" contenido 11. 912 familias de proteínas.

Bases de datos de bioinformática

Bases de datos químicas

Estructura de proteínas

Biobanco

Un biobanco de investigación es una estructura que recoge de manera organizada material biológico útil para la investigación clínica y no para el uso de traspla...

Herencia mendeliana en el hombre

El Proyecto de Herencia Mendeliana en el Hombre, también conocido como MIM, es una base de datos que cataloga todas las enfermedades con un componente genético....

Biotechnology

Genética Aplicada

Investigación clínica

Esta página se basa en el artículo de Wikipedia: Fuente, Autores, Licencia Creative Commons Reconocimiento-CompartirIgual.
This page is based on the Wikipedia article: Source, Authors, Creative Commons Attribution-ShareAlike License.
contactos
Política de privacidad , Descargos de responsabilidad