La European Challenge Cup 2012-13 (en inglés 2012-13 European Challenge Cup; en francés Challenge européen 2012-13), por razones de patrocinio también conocida como la Amlin Challenge Cup 2012-13, fue la 17ª edición de la European Challenge Cup, una competición de Clubes de 15 hombres organizada por la European Rugby Cup como un torneo de cadetes de la Heineken Cup. Al igual que las tres ediciones anteriores aceptadas a partir de los cuartos de final, los tres mejores equipos se clasificaron a las etapas eliminatorias de la Copa Heineken por segunda vez consecutiva, y la tercera en las cuatro ediciones hasta entonces jugadas con la nueva fórmula, la victoria final fue a uno de los equipos procedentes de la competición para clasificar más alto: para ganar el torneo fue, de hecho, Leinster, primer club irlandés en ingresar su nombre en el palmarès de la Challenge Cup, que en la final venció al Stade français francés por 34 a 13 Se disputó del 11 de octubre de 2012 al 17 de mayo de 2013 entre 20 equipos de 6 federaciones (Francia, Gales, Inglaterra, Italia, Rumania y España). Aunque la victoria en la Challenge Cup aseguró la clasificación para la Heineken Cup de la temporada siguiente, el resultado no fue de importancia para Leinster, ya que se clasificó para ese evento con su victoria final en la Pro12 2012-13.
La fórmula fue la introducida en 2009-10 por la Copa de Europa de Rugby : los 20 equipos se dividieron en 5 grupos italianos de 4 equipos cada uno con competiciones de ida y vuelta; solo los cinco equipos ganadores del grupo fueron promovidos a los cuartos de final, junto con los tres mejores no clasificados a los cuartos de final de la Copa Heineken 2012-13. Los primeros cuatro ganadores de grupos de la Challenge Cup fueron premiados con un sembrado de 1 a 4, determinado en base a la puntuación lograda en el grupo y, a continuación, los goles marcados y los puntos de diferencia hechos/sufridos; con el mismo criterio de puntuación Los tres equipos de la Heineken Cup recibieron el sembrado de 5 a 7. El quinto mejor ganador recibió el número 8 de sembrado y tuvo que enfrentarse al ganador con el número 1 de sembrado en los cuartos de final. Los equipos sembrados del 1 al 4 jugaron el partido de cuartos de final en el infield; en las semifinales, el equipo local fue el que tuvo el mejor sembrado al comienzo de la fase eliminatoria. La final se celebró en el RDS Arena en Dublín, República de Irlanda.